Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms