Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET52

Cts6, Cathepsin-6, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts6Q9ET52 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cts6Q9ET52 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cts6Q9ET52 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cts6Q9ET52 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cts6Q9ET52 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms