Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim39Q9ESN2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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