Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms