Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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