Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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