Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms