Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx5Q9D8U8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx5Q9D8U8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx5Q9D8U8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx5Q9D8U8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx5Q9D8U8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx5Q9D8U8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snx5Q9D8U8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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