Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necab3Q9D6J4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necab3Q9D6J4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necab3Q9D6J4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms