Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms