Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf128Q9D304 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms