Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms