Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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