Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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