Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms