Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh4Q99MT2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms