Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms