Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms