Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fyco1Q8VDC1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms