Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC82

Rhbdl1, Rhomboid-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl1Q8VC82 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhbdl1Q8VC82 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms