Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc47a1Q8K0H1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc47a1Q8K0H1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms