Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms