Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc28aQ8CEI3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms