Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ssuh2Q8C3L1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ssuh2Q8C3L1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ssuh2Q8C3L1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ssuh2Q8C3L1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ssuh2Q8C3L1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ssuh2Q8C3L1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ssuh2Q8C3L1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ssuh2Q8C3L1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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