Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms