Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms