Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms