Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccp110Q7TSH4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccp110Q7TSH4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms