Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms