Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms