Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms