Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C1qtnf6Q6IR41 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf6Q6IR41 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms