Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC080695Q66JY9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC080695Q66JY9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms