Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms