Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ssr4Q62186 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ssr4Q62186 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ssr4Q62186 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ssr4Q62186 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssr4Q62186 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms