Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms