Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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