Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms