Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms