Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2al1nQ497L1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms