Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ldlrad2Q3V0V0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ldlrad2Q3V0V0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldlrad2Q3V0V0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldlrad2Q3V0V0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldlrad2Q3V0V0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldlrad2Q3V0V0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms