Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc27Q3V036 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms