Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms