Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms