Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trafd1Q3UDK1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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