Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops9Q3U898 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops9Q3U898 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops9Q3U898 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops9Q3U898 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cops9Q3U898 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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