Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf40Q3U319 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf40Q3U319 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf40Q3U319 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf40Q3U319 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rnf40Q3U319 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf40Q3U319 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rnf40Q3U319 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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