Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccbe1Q3MI99 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccbe1Q3MI99 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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