Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnn2Q08093 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms