Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms